Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IKZF1Q13422 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IKZF1Q13422 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms