Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHAF1AQ13111 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHAF1AQ13111 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
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