Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC42.2■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
PRDM2Q13029 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC42.17■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
PRDM2Q13029 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC42.11■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PRDM2Q13029 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC42.06■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PRDM2Q13029 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC42■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms