Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BNIP3Q12983 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3Q12983 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms