Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXI1Q12951 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXI1Q12951 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXI1Q12951 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXI1Q12951 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXI1Q12951 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXI1Q12951 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXI1Q12951 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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