Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STX4Q12846 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX4Q12846 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX4Q12846 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX4Q12846 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX4Q12846 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX4Q12846 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX4Q12846 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX4Q12846 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX4Q12846 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX4Q12846 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX4Q12846 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX4Q12846 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STX4Q12846 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX4Q12846 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX4Q12846 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX4Q12846 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX4Q12846 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX4Q12846 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX4Q12846 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX4Q12846 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX4Q12846 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX4Q12846 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STX4Q12846 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX4Q12846 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX4Q12846 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX4Q12846 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STX4Q12846 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX4Q12846 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX4Q12846 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX4Q12846 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX4Q12846 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX4Q12846 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STX4Q12846 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX4Q12846 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX4Q12846 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX4Q12846 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX4Q12846 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX4Q12846 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX4Q12846 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX4Q12846 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX4Q12846 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX4Q12846 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX4Q12846 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX4Q12846 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX4Q12846 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX4Q12846 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX4Q12846 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX4Q12846 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX4Q12846 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX4Q12846 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX4Q12846 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STX4Q12846 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX4Q12846 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX4Q12846 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX4Q12846 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX4Q12846 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX4Q12846 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX4Q12846 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STX4Q12846 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX4Q12846 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX4Q12846 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STX4Q12846 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX4Q12846 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX4Q12846 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX4Q12846 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX4Q12846 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX4Q12846 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX4Q12846 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX4Q12846 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX4Q12846 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX4Q12846 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX4Q12846 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX4Q12846 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX4Q12846 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX4Q12846 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX4Q12846 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX4Q12846 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX4Q12846 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX4Q12846 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX4Q12846 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX4Q12846 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX4Q12846 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX4Q12846 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX4Q12846 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX4Q12846 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX4Q12846 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX4Q12846 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX4Q12846 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX4Q12846 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX4Q12846 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX4Q12846 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STX4Q12846 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX4Q12846 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX4Q12846 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX4Q12846 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX4Q12846 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX4Q12846 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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