Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYCNQ0VAF6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms