Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CXCL9Q07325 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CXCL9Q07325 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CXCL9Q07325 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms