Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms