Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CFHR1Q03591 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms