Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX5Q02548 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms