Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC3AQ02505 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC3AQ02505 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms