Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK3Q00526 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK3Q00526 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms