Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CRB1P82279 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CRB1P82279 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CRB1P82279 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CRB1P82279 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CRB1P82279 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CRB1P82279 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CRB1P82279 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CRB1P82279 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CRB1P82279 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CRB1P82279 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CRB1P82279 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CRB1P82279 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CRB1P82279 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CRB1P82279 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CRB1P82279 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CRB1P82279 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CRB1P82279 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CRB1P82279 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CRB1P82279 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CRB1P82279 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CRB1P82279 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CRB1P82279 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CRB1P82279 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CRB1P82279 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CRB1P82279 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CRB1P82279 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CRB1P82279 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CRB1P82279 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CRB1P82279 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CRB1P82279 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CRB1P82279 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CRB1P82279 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CRB1P82279 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CRB1P82279 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CRB1P82279 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CRB1P82279 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CRB1P82279 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CRB1P82279 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CRB1P82279 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CRB1P82279 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CRB1P82279 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CRB1P82279 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CRB1P82279 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CRB1P82279 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CRB1P82279 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CRB1P82279 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CRB1P82279 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CRB1P82279 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CRB1P82279 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CRB1P82279 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRB1P82279 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRB1P82279 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRB1P82279 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRB1P82279 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRB1P82279 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRB1P82279 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRB1P82279 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRB1P82279 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRB1P82279 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRB1P82279 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CRB1P82279 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CRB1P82279 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CRB1P82279 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CRB1P82279 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CRB1P82279 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CRB1P82279 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CRB1P82279 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CRB1P82279 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CRB1P82279 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CRB1P82279 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CRB1P82279 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CRB1P82279 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CRB1P82279 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CRB1P82279 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CRB1P82279 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CRB1P82279 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CRB1P82279 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CRB1P82279 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CRB1P82279 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CRB1P82279 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CRB1P82279 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CRB1P82279 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CRB1P82279 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CRB1P82279 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CRB1P82279 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CRB1P82279 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CRB1P82279 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CRB1P82279 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CRB1P82279 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CRB1P82279 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CRB1P82279 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CRB1P82279 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CRB1P82279 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CRB1P82279 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CRB1P82279 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CRB1P82279 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CRB1P82279 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CRB1P82279 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CRB1P82279 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms