Protein–RNA interactions for Protein: P81408

FAM189B, Protein FAM189B, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM189BP81408 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM189BP81408 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM189BP81408 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM189BP81408 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM189BP81408 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 800 ms