Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL8P80075 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL8P80075 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL8P80075 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL8P80075 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL8P80075 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL8P80075 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL8P80075 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL8P80075 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL8P80075 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL8P80075 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL8P80075 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL8P80075 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL8P80075 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL8P80075 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL8P80075 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL8P80075 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL8P80075 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL8P80075 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL8P80075 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL8P80075 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL8P80075 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL8P80075 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL8P80075 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL8P80075 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL8P80075 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL8P80075 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL8P80075 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL8P80075 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL8P80075 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL8P80075 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL8P80075 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL8P80075 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL8P80075 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL8P80075 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL8P80075 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL8P80075 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL8P80075 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL8P80075 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL8P80075 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL8P80075 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL8P80075 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL8P80075 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL8P80075 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL8P80075 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL8P80075 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL8P80075 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL8P80075 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL8P80075 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL8P80075 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL8P80075 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL8P80075 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL8P80075 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL8P80075 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL8P80075 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL8P80075 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL8P80075 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL8P80075 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL8P80075 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL8P80075 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL8P80075 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL8P80075 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL8P80075 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL8P80075 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL8P80075 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL8P80075 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL8P80075 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL8P80075 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL8P80075 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL8P80075 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCL8P80075 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL8P80075 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL8P80075 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL8P80075 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL8P80075 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL8P80075 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL8P80075 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL8P80075 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms