Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN2P57739 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN2P57739 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN2P57739 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms