Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OXCT1P55809 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXCT1P55809 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXCT1P55809 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms