Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GFERP55789 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFERP55789 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFERP55789 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFERP55789 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFERP55789 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFERP55789 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFERP55789 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFERP55789 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFERP55789 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFERP55789 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFERP55789 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFERP55789 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFERP55789 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFERP55789 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFERP55789 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFERP55789 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFERP55789 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFERP55789 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFERP55789 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFERP55789 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFERP55789 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFERP55789 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFERP55789 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFERP55789 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFERP55789 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFERP55789 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFERP55789 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GFERP55789 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFERP55789 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFERP55789 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GFERP55789 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFERP55789 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFERP55789 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GFERP55789 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFERP55789 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFERP55789 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFERP55789 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFERP55789 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFERP55789 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFERP55789 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFERP55789 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFERP55789 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFERP55789 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFERP55789 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFERP55789 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GFERP55789 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFERP55789 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFERP55789 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFERP55789 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFERP55789 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFERP55789 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFERP55789 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFERP55789 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFERP55789 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFERP55789 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFERP55789 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFERP55789 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GFERP55789 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFERP55789 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFERP55789 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFERP55789 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFERP55789 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFERP55789 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFERP55789 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFERP55789 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFERP55789 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFERP55789 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFERP55789 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFERP55789 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFERP55789 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFERP55789 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFERP55789 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFERP55789 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFERP55789 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFERP55789 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFERP55789 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFERP55789 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFERP55789 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GFERP55789 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFERP55789 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFERP55789 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFERP55789 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFERP55789 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFERP55789 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFERP55789 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GFERP55789 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GFERP55789 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFERP55789 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms