Protein–RNA interactions for Protein: P54578

USP14, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP14P54578 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP14P54578 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP14P54578 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP14P54578 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP14P54578 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP14P54578 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP14P54578 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP14P54578 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP14P54578 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP14P54578 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP14P54578 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP14P54578 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP14P54578 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP14P54578 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP14P54578 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP14P54578 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP14P54578 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP14P54578 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP14P54578 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP14P54578 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP14P54578 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP14P54578 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP14P54578 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP14P54578 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP14P54578 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP14P54578 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP14P54578 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP14P54578 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP14P54578 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP14P54578 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP14P54578 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP14P54578 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP14P54578 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP14P54578 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP14P54578 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP14P54578 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP14P54578 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP14P54578 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP14P54578 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP14P54578 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP14P54578 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP14P54578 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP14P54578 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP14P54578 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP14P54578 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP14P54578 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP14P54578 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP14P54578 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP14P54578 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP14P54578 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP14P54578 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP14P54578 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP14P54578 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP14P54578 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP14P54578 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP14P54578 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP14P54578 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP14P54578 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP14P54578 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP14P54578 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP14P54578 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP14P54578 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP14P54578 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP14P54578 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP14P54578 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP14P54578 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
USP14P54578 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP14P54578 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP14P54578 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP14P54578 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP14P54578 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP14P54578 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP14P54578 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP14P54578 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP14P54578 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP14P54578 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP14P54578 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP14P54578 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP14P54578 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP14P54578 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP14P54578 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP14P54578 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP14P54578 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP14P54578 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP14P54578 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP14P54578 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP14P54578 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP14P54578 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP14P54578 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP14P54578 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP14P54578 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP14P54578 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP14P54578 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP14P54578 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP14P54578 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP14P54578 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP14P54578 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP14P54578 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP14P54578 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP14P54578 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms