Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YARSP54577 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YARSP54577 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YARSP54577 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YARSP54577 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YARSP54577 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
YARSP54577 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
YARSP54577 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
YARSP54577 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YARSP54577 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
YARSP54577 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YARSP54577 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
YARSP54577 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
YARSP54577 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
YARSP54577 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
YARSP54577 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
YARSP54577 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
YARSP54577 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
YARSP54577 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
YARSP54577 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
YARSP54577 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
YARSP54577 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
YARSP54577 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
YARSP54577 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
YARSP54577 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
YARSP54577 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
YARSP54577 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
YARSP54577 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
YARSP54577 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
YARSP54577 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
YARSP54577 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
YARSP54577 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YARSP54577 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YARSP54577 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YARSP54577 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
YARSP54577 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YARSP54577 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YARSP54577 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YARSP54577 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
YARSP54577 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YARSP54577 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YARSP54577 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
YARSP54577 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
YARSP54577 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
YARSP54577 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
YARSP54577 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
YARSP54577 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
YARSP54577 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
YARSP54577 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
YARSP54577 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YARSP54577 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YARSP54577 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
YARSP54577 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YARSP54577 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YARSP54577 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
YARSP54577 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
YARSP54577 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
YARSP54577 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
YARSP54577 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YARSP54577 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YARSP54577 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
YARSP54577 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
YARSP54577 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YARSP54577 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YARSP54577 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YARSP54577 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YARSP54577 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YARSP54577 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YARSP54577 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YARSP54577 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
YARSP54577 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
YARSP54577 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
YARSP54577 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YARSP54577 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YARSP54577 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
YARSP54577 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YARSP54577 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
YARSP54577 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YARSP54577 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YARSP54577 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YARSP54577 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YARSP54577 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YARSP54577 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YARSP54577 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YARSP54577 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YARSP54577 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YARSP54577 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
YARSP54577 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
YARSP54577 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YARSP54577 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms