Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN1P54253 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms