Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGDP52209 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGDP52209 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGDP52209 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PGDP52209 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGDP52209 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGDP52209 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGDP52209 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGDP52209 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PGDP52209 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGDP52209 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGDP52209 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGDP52209 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGDP52209 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGDP52209 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGDP52209 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGDP52209 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGDP52209 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGDP52209 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGDP52209 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGDP52209 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGDP52209 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGDP52209 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGDP52209 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGDP52209 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGDP52209 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGDP52209 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGDP52209 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGDP52209 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGDP52209 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGDP52209 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGDP52209 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGDP52209 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGDP52209 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGDP52209 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGDP52209 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGDP52209 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGDP52209 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGDP52209 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGDP52209 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGDP52209 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGDP52209 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGDP52209 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGDP52209 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGDP52209 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGDP52209 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGDP52209 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGDP52209 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGDP52209 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGDP52209 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGDP52209 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGDP52209 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGDP52209 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGDP52209 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGDP52209 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGDP52209 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGDP52209 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGDP52209 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGDP52209 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGDP52209 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGDP52209 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGDP52209 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGDP52209 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGDP52209 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGDP52209 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGDP52209 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGDP52209 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGDP52209 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGDP52209 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGDP52209 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGDP52209 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGDP52209 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGDP52209 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGDP52209 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGDP52209 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGDP52209 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGDP52209 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGDP52209 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGDP52209 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGDP52209 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms