Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK7P50613 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK7P50613 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK7P50613 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK7P50613 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK7P50613 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK7P50613 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK7P50613 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK7P50613 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK7P50613 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK7P50613 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK7P50613 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK7P50613 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK7P50613 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK7P50613 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK7P50613 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK7P50613 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK7P50613 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK7P50613 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK7P50613 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK7P50613 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK7P50613 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDK7P50613 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK7P50613 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK7P50613 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK7P50613 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK7P50613 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK7P50613 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK7P50613 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK7P50613 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK7P50613 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK7P50613 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK7P50613 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK7P50613 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK7P50613 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK7P50613 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK7P50613 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK7P50613 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK7P50613 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK7P50613 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK7P50613 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK7P50613 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK7P50613 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK7P50613 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK7P50613 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK7P50613 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK7P50613 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK7P50613 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK7P50613 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK7P50613 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK7P50613 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK7P50613 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK7P50613 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK7P50613 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK7P50613 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK7P50613 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK7P50613 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK7P50613 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK7P50613 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK7P50613 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK7P50613 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK7P50613 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK7P50613 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK7P50613 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK7P50613 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK7P50613 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK7P50613 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK7P50613 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK7P50613 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK7P50613 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK7P50613 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK7P50613 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK7P50613 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK7P50613 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK7P50613 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK7P50613 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK7P50613 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK7P50613 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK7P50613 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK7P50613 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK7P50613 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK7P50613 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK7P50613 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK7P50613 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK7P50613 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK7P50613 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK7P50613 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK7P50613 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK7P50613 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK7P50613 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK7P50613 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK7P50613 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK7P50613 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK7P50613 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK7P50613 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK7P50613 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK7P50613 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK7P50613 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK7P50613 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK7P50613 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms