Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF10P50591 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms