Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX2P50458 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX2P50458 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX2P50458 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX2P50458 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX2P50458 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX2P50458 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX2P50458 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX2P50458 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX2P50458 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX2P50458 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX2P50458 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX2P50458 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX2P50458 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX2P50458 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX2P50458 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX2P50458 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX2P50458 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX2P50458 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX2P50458 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX2P50458 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX2P50458 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX2P50458 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX2P50458 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX2P50458 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX2P50458 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX2P50458 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX2P50458 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX2P50458 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX2P50458 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX2P50458 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX2P50458 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX2P50458 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX2P50458 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX2P50458 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX2P50458 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX2P50458 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX2P50458 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX2P50458 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX2P50458 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX2P50458 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX2P50458 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX2P50458 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX2P50458 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX2P50458 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX2P50458 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX2P50458 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX2P50458 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX2P50458 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX2P50458 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX2P50458 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX2P50458 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX2P50458 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX2P50458 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX2P50458 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX2P50458 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX2P50458 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX2P50458 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX2P50458 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX2P50458 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX2P50458 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX2P50458 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX2P50458 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX2P50458 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX2P50458 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX2P50458 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX2P50458 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX2P50458 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX2P50458 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX2P50458 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX2P50458 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LHX2P50458 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX2P50458 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX2P50458 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX2P50458 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX2P50458 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX2P50458 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX2P50458 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX2P50458 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX2P50458 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms