Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RARRES1P49788 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RARRES1P49788 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RARRES1P49788 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARRES1P49788 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARRES1P49788 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 351.3 ms