Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA4P48169 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms