Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A11P48066 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A11P48066 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms