Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSKP43235 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSKP43235 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSKP43235 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSKP43235 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSKP43235 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSKP43235 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSKP43235 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSKP43235 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSKP43235 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSKP43235 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSKP43235 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSKP43235 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSKP43235 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSKP43235 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSKP43235 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSKP43235 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSKP43235 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSKP43235 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSKP43235 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSKP43235 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSKP43235 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSKP43235 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSKP43235 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSKP43235 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSKP43235 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSKP43235 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSKP43235 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSKP43235 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSKP43235 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSKP43235 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSKP43235 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSKP43235 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSKP43235 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSKP43235 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSKP43235 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSKP43235 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSKP43235 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSKP43235 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSKP43235 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSKP43235 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSKP43235 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSKP43235 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSKP43235 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSKP43235 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSKP43235 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSKP43235 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSKP43235 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSKP43235 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSKP43235 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSKP43235 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSKP43235 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSKP43235 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSKP43235 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSKP43235 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSKP43235 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSKP43235 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSKP43235 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSKP43235 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSKP43235 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSKP43235 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTSKP43235 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSKP43235 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSKP43235 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSKP43235 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSKP43235 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSKP43235 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSKP43235 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSKP43235 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSKP43235 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSKP43235 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSKP43235 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSKP43235 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSKP43235 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSKP43235 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSKP43235 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSKP43235 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSKP43235 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSKP43235 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSKP43235 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSKP43235 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSKP43235 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSKP43235 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSKP43235 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSKP43235 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTSKP43235 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTSKP43235 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSKP43235 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSKP43235 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSKP43235 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSKP43235 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSKP43235 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSKP43235 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSKP43235 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSKP43235 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSKP43235 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSKP43235 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSKP43235 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSKP43235 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSKP43235 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms