Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFC5P40937 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFC5P40937 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFC5P40937 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFC5P40937 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFC5P40937 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFC5P40937 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFC5P40937 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFC5P40937 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC5P40937 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC5P40937 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC5P40937 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFC5P40937 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFC5P40937 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFC5P40937 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFC5P40937 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFC5P40937 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFC5P40937 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFC5P40937 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RFC5P40937 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RFC5P40937 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RFC5P40937 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFC5P40937 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFC5P40937 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFC5P40937 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFC5P40937 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFC5P40937 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFC5P40937 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFC5P40937 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFC5P40937 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFC5P40937 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFC5P40937 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFC5P40937 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFC5P40937 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFC5P40937 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFC5P40937 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFC5P40937 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFC5P40937 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFC5P40937 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFC5P40937 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFC5P40937 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RFC5P40937 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFC5P40937 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFC5P40937 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFC5P40937 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFC5P40937 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFC5P40937 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFC5P40937 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC5P40937 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC5P40937 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC5P40937 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC5P40937 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC5P40937 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC5P40937 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC5P40937 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC5P40937 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC5P40937 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFC5P40937 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RFC5P40937 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFC5P40937 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFC5P40937 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFC5P40937 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RFC5P40937 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFC5P40937 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFC5P40937 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFC5P40937 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFC5P40937 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RFC5P40937 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFC5P40937 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC5P40937 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC5P40937 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC5P40937 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC5P40937 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC5P40937 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC5P40937 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFC5P40937 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFC5P40937 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFC5P40937 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFC5P40937 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RFC5P40937 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFC5P40937 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFC5P40937 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFC5P40937 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFC5P40937 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFC5P40937 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFC5P40937 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFC5P40937 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFC5P40937 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms