Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SREBF1P36956 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SREBF1P36956 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SREBF1P36956 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SREBF1P36956 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SREBF1P36956 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SREBF1P36956 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SREBF1P36956 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SREBF1P36956 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SREBF1P36956 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SREBF1P36956 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SREBF1P36956 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SREBF1P36956 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SREBF1P36956 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SREBF1P36956 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SREBF1P36956 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SREBF1P36956 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SREBF1P36956 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SREBF1P36956 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SREBF1P36956 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SREBF1P36956 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SREBF1P36956 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF1P36956 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF1P36956 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms