Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP5C1P36542 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP5C1P36542 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms