Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT20P35900 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT20P35900 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT20P35900 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT20P35900 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT20P35900 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT20P35900 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT20P35900 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT20P35900 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT20P35900 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT20P35900 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT20P35900 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT20P35900 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT20P35900 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT20P35900 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT20P35900 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT20P35900 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT20P35900 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT20P35900 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT20P35900 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT20P35900 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT20P35900 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT20P35900 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT20P35900 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT20P35900 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT20P35900 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT20P35900 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT20P35900 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT20P35900 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT20P35900 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT20P35900 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT20P35900 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT20P35900 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT20P35900 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT20P35900 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT20P35900 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT20P35900 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT20P35900 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT20P35900 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT20P35900 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT20P35900 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT20P35900 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT20P35900 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT20P35900 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT20P35900 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT20P35900 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT20P35900 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT20P35900 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT20P35900 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT20P35900 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT20P35900 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT20P35900 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT20P35900 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT20P35900 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT20P35900 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT20P35900 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT20P35900 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT20P35900 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT20P35900 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT20P35900 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT20P35900 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT20P35900 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT20P35900 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT20P35900 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT20P35900 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT20P35900 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT20P35900 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT20P35900 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT20P35900 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT20P35900 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT20P35900 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT20P35900 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT20P35900 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT20P35900 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT20P35900 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT20P35900 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT20P35900 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT20P35900 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT20P35900 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT20P35900 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT20P35900 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT20P35900 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT20P35900 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT20P35900 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT20P35900 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT20P35900 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT20P35900 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT20P35900 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT20P35900 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT20P35900 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT20P35900 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT20P35900 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT20P35900 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT20P35900 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT20P35900 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT20P35900 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT20P35900 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT20P35900 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT20P35900 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT20P35900 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms