Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSP1P33241 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSP1P33241 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSP1P33241 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSP1P33241 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSP1P33241 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSP1P33241 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSP1P33241 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSP1P33241 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSP1P33241 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSP1P33241 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSP1P33241 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSP1P33241 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSP1P33241 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSP1P33241 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSP1P33241 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSP1P33241 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSP1P33241 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSP1P33241 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSP1P33241 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSP1P33241 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSP1P33241 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSP1P33241 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSP1P33241 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSP1P33241 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LSP1P33241 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSP1P33241 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSP1P33241 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSP1P33241 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSP1P33241 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSP1P33241 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSP1P33241 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSP1P33241 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSP1P33241 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSP1P33241 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSP1P33241 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSP1P33241 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSP1P33241 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSP1P33241 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSP1P33241 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSP1P33241 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSP1P33241 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSP1P33241 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSP1P33241 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSP1P33241 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSP1P33241 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSP1P33241 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSP1P33241 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSP1P33241 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSP1P33241 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSP1P33241 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LSP1P33241 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSP1P33241 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSP1P33241 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSP1P33241 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSP1P33241 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSP1P33241 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSP1P33241 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSP1P33241 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSP1P33241 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSP1P33241 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSP1P33241 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSP1P33241 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSP1P33241 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSP1P33241 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSP1P33241 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSP1P33241 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSP1P33241 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSP1P33241 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSP1P33241 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSP1P33241 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSP1P33241 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSP1P33241 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSP1P33241 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSP1P33241 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSP1P33241 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSP1P33241 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSP1P33241 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSP1P33241 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSP1P33241 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSP1P33241 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSP1P33241 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSP1P33241 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSP1P33241 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSP1P33241 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSP1P33241 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSP1P33241 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSP1P33241 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSP1P33241 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms