Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG3P32926 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG3P32926 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG3P32926 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG3P32926 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG3P32926 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG3P32926 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG3P32926 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG3P32926 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG3P32926 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSG3P32926 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSG3P32926 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSG3P32926 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSG3P32926 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSG3P32926 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG3P32926 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG3P32926 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG3P32926 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG3P32926 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG3P32926 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG3P32926 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG3P32926 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG3P32926 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG3P32926 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG3P32926 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG3P32926 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG3P32926 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG3P32926 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG3P32926 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG3P32926 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG3P32926 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG3P32926 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG3P32926 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG3P32926 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG3P32926 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG3P32926 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG3P32926 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG3P32926 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG3P32926 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG3P32926 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG3P32926 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG3P32926 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG3P32926 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG3P32926 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSG3P32926 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSG3P32926 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSG3P32926 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSG3P32926 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSG3P32926 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG3P32926 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG3P32926 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG3P32926 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG3P32926 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG3P32926 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG3P32926 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG3P32926 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSG3P32926 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSG3P32926 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DSG3P32926 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DSG3P32926 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSG3P32926 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSG3P32926 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSG3P32926 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSG3P32926 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSG3P32926 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG3P32926 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG3P32926 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG3P32926 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG3P32926 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG3P32926 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG3P32926 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG3P32926 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG3P32926 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG3P32926 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG3P32926 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSG3P32926 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSG3P32926 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DSG3P32926 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSG3P32926 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSG3P32926 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSG3P32926 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DSG3P32926 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DSG3P32926 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DSG3P32926 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DSG3P32926 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DSG3P32926 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DSG3P32926 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSG3P32926 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSG3P32926 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSG3P32926 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSG3P32926 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSG3P32926 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSG3P32926 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSG3P32926 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG3P32926 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG3P32926 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG3P32926 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG3P32926 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG3P32926 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG3P32926 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms