Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC3AP31941 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC3AP31941 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3AP31941 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms