Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC8P31273 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC8P31273 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms