Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
CLIP1P30622 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CLIP1P30622 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
CLIP1P30622 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
CLIP1P30622 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms