Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB5P28074 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB5P28074 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms