Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYF6P23409 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYF6P23409 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYF6P23409 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYF6P23409 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYF6P23409 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYF6P23409 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYF6P23409 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYF6P23409 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYF6P23409 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYF6P23409 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYF6P23409 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYF6P23409 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYF6P23409 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYF6P23409 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYF6P23409 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYF6P23409 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYF6P23409 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYF6P23409 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYF6P23409 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYF6P23409 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYF6P23409 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYF6P23409 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYF6P23409 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYF6P23409 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYF6P23409 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYF6P23409 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYF6P23409 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYF6P23409 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYF6P23409 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYF6P23409 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
MYF6P23409 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYF6P23409 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYF6P23409 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYF6P23409 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYF6P23409 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYF6P23409 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYF6P23409 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYF6P23409 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYF6P23409 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYF6P23409 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYF6P23409 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYF6P23409 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYF6P23409 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYF6P23409 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYF6P23409 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYF6P23409 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYF6P23409 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYF6P23409 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYF6P23409 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYF6P23409 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYF6P23409 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYF6P23409 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYF6P23409 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYF6P23409 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYF6P23409 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYF6P23409 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYF6P23409 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYF6P23409 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYF6P23409 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYF6P23409 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF6P23409 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF6P23409 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF6P23409 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF6P23409 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF6P23409 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF6P23409 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF6P23409 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF6P23409 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF6P23409 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF6P23409 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF6P23409 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF6P23409 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF6P23409 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF6P23409 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF6P23409 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF6P23409 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF6P23409 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF6P23409 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF6P23409 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF6P23409 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF6P23409 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF6P23409 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF6P23409 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF6P23409 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF6P23409 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF6P23409 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF6P23409 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms