Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF3P20783 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF3P20783 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF3P20783 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF3P20783 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF3P20783 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF3P20783 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF3P20783 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF3P20783 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF3P20783 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF3P20783 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF3P20783 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF3P20783 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NTF3P20783 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF3P20783 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF3P20783 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF3P20783 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF3P20783 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF3P20783 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF3P20783 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF3P20783 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF3P20783 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF3P20783 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF3P20783 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF3P20783 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF3P20783 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF3P20783 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF3P20783 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF3P20783 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF3P20783 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF3P20783 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF3P20783 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF3P20783 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF3P20783 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF3P20783 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF3P20783 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF3P20783 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF3P20783 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF3P20783 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF3P20783 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF3P20783 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF3P20783 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF3P20783 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF3P20783 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF3P20783 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF3P20783 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF3P20783 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NTF3P20783 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NTF3P20783 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTF3P20783 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTF3P20783 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NTF3P20783 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTF3P20783 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTF3P20783 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTF3P20783 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NTF3P20783 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NTF3P20783 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTF3P20783 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTF3P20783 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTF3P20783 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTF3P20783 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTF3P20783 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTF3P20783 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTF3P20783 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTF3P20783 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTF3P20783 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTF3P20783 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTF3P20783 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTF3P20783 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTF3P20783 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTF3P20783 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTF3P20783 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTF3P20783 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF3P20783 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF3P20783 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF3P20783 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF3P20783 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF3P20783 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF3P20783 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTF3P20783 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF3P20783 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF3P20783 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF3P20783 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF3P20783 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF3P20783 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF3P20783 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF3P20783 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF3P20783 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NTF3P20783 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF3P20783 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF3P20783 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF3P20783 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF3P20783 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF3P20783 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF3P20783 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF3P20783 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTF3P20783 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF3P20783 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF3P20783 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTF3P20783 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms