Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMNB1P20700 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMNB1P20700 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMNB1P20700 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms