Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VCAM1P19320 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VCAM1P19320 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms