Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB5P18084 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB5P18084 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 797.5 ms