Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPB42P16452 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPB42P16452 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPB42P16452 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPB42P16452 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB42P16452 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB42P16452 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB42P16452 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB42P16452 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB42P16452 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB42P16452 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB42P16452 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB42P16452 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB42P16452 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB42P16452 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB42P16452 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB42P16452 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB42P16452 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB42P16452 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB42P16452 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB42P16452 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB42P16452 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB42P16452 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB42P16452 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB42P16452 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB42P16452 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB42P16452 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPB42P16452 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB42P16452 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB42P16452 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB42P16452 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB42P16452 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB42P16452 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB42P16452 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB42P16452 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB42P16452 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB42P16452 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB42P16452 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB42P16452 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB42P16452 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB42P16452 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB42P16452 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB42P16452 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB42P16452 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB42P16452 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB42P16452 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB42P16452 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB42P16452 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB42P16452 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB42P16452 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB42P16452 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB42P16452 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB42P16452 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB42P16452 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB42P16452 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB42P16452 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB42P16452 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB42P16452 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB42P16452 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB42P16452 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB42P16452 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB42P16452 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB42P16452 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB42P16452 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB42P16452 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPB42P16452 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPB42P16452 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPB42P16452 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EPB42P16452 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPB42P16452 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB42P16452 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB42P16452 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB42P16452 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB42P16452 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB42P16452 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB42P16452 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB42P16452 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB42P16452 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms