Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSPP15924 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSPP15924 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSPP15924 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSPP15924 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSPP15924 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSPP15924 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DSPP15924 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSPP15924 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DSPP15924 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSPP15924 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DSPP15924 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSPP15924 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSPP15924 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSPP15924 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DSPP15924 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSPP15924 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSPP15924 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSPP15924 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSPP15924 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSPP15924 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSPP15924 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSPP15924 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSPP15924 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSPP15924 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSPP15924 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSPP15924 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSPP15924 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DSPP15924 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSPP15924 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSPP15924 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSPP15924 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSPP15924 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSPP15924 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSPP15924 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSPP15924 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSPP15924 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSPP15924 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSPP15924 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSPP15924 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSPP15924 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSPP15924 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSPP15924 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSPP15924 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSPP15924 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSPP15924 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSPP15924 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSPP15924 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSPP15924 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSPP15924 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSPP15924 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSPP15924 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSPP15924 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSPP15924 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSPP15924 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSPP15924 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSPP15924 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSPP15924 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSPP15924 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSPP15924 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSPP15924 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSPP15924 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DSPP15924 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSPP15924 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSPP15924 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSPP15924 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSPP15924 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSPP15924 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSPP15924 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSPP15924 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSPP15924 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSPP15924 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSPP15924 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSPP15924 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSPP15924 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSPP15924 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSPP15924 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSPP15924 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSPP15924 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSPP15924 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSPP15924 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSPP15924 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSPP15924 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DSPP15924 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSPP15924 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSPP15924 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSPP15924 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSPP15924 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSPP15924 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSPP15924 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSPP15924 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSPP15924 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSPP15924 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSPP15924 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSPP15924 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSPP15924 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSPP15924 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSPP15924 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSPP15924 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSPP15924 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms