Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRA1P14867 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA1P14867 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms