Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCP1P13796 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCP1P13796 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCP1P13796 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCP1P13796 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCP1P13796 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCP1P13796 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCP1P13796 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCP1P13796 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCP1P13796 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCP1P13796 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCP1P13796 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCP1P13796 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCP1P13796 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCP1P13796 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCP1P13796 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCP1P13796 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCP1P13796 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCP1P13796 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCP1P13796 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCP1P13796 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCP1P13796 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCP1P13796 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCP1P13796 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCP1P13796 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCP1P13796 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCP1P13796 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCP1P13796 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCP1P13796 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCP1P13796 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCP1P13796 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCP1P13796 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCP1P13796 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCP1P13796 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCP1P13796 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCP1P13796 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCP1P13796 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCP1P13796 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCP1P13796 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCP1P13796 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCP1P13796 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCP1P13796 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCP1P13796 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LCP1P13796 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCP1P13796 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCP1P13796 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCP1P13796 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCP1P13796 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCP1P13796 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCP1P13796 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCP1P13796 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LCP1P13796 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LCP1P13796 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCP1P13796 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCP1P13796 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCP1P13796 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCP1P13796 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCP1P13796 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCP1P13796 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCP1P13796 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCP1P13796 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCP1P13796 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCP1P13796 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LCP1P13796 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCP1P13796 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCP1P13796 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCP1P13796 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCP1P13796 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCP1P13796 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCP1P13796 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCP1P13796 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCP1P13796 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCP1P13796 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LCP1P13796 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCP1P13796 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCP1P13796 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LCP1P13796 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCP1P13796 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCP1P13796 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCP1P13796 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCP1P13796 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCP1P13796 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCP1P13796 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCP1P13796 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCP1P13796 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCP1P13796 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCP1P13796 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCP1P13796 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCP1P13796 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCP1P13796 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms