Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCANP13611 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCANP13611 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCANP13611 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCANP13611 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCANP13611 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCANP13611 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCANP13611 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCANP13611 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCANP13611 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCANP13611 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VCANP13611 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
VCANP13611 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VCANP13611 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCANP13611 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCANP13611 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCANP13611 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCANP13611 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCANP13611 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCANP13611 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCANP13611 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCANP13611 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCANP13611 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCANP13611 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VCANP13611 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCANP13611 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCANP13611 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCANP13611 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCANP13611 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCANP13611 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCANP13611 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCANP13611 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCANP13611 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCANP13611 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VCANP13611 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCANP13611 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCANP13611 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCANP13611 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCANP13611 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCANP13611 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCANP13611 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCANP13611 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCANP13611 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCANP13611 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCANP13611 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCANP13611 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCANP13611 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCANP13611 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCANP13611 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VCANP13611 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCANP13611 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCANP13611 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCANP13611 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCANP13611 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCANP13611 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCANP13611 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCANP13611 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCANP13611 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCANP13611 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCANP13611 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCANP13611 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCANP13611 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCANP13611 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCANP13611 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCANP13611 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCANP13611 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCANP13611 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VCANP13611 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCANP13611 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCANP13611 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCANP13611 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCANP13611 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCANP13611 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCANP13611 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCANP13611 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCANP13611 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCANP13611 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VCANP13611 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCANP13611 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VCANP13611 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCANP13611 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VCANP13611 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCANP13611 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCANP13611 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCANP13611 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCANP13611 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCANP13611 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCANP13611 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VCANP13611 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCANP13611 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCANP13611 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCANP13611 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCANP13611 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCANP13611 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCANP13611 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCANP13611 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCANP13611 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCANP13611 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCANP13611 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCANP13611 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms